Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPL2Q05D32 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms