Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPGP40121 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPGP40121 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPGP40121 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPGP40121 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPGP40121 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPGP40121 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPGP40121 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPGP40121 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAPGP40121 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms