Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4AP0C0L4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4AP0C0L4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms