Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3BMQ9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H3BMQ9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BMQ9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BMQ9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BMQ9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H3BMQ9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H3BMQ9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3BMQ9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms