Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms