Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX3A6NHT5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms