Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms