Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms