Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTLNQ9NXG0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTLNQ9NXG0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms