Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CSAG1Q6PB30 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms