Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms