Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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