Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms