Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms