Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIM1P81133 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIM1P81133 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIM1P81133 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIM1P81133 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIM1P81133 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIM1P81133 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIM1P81133 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIM1P81133 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIM1P81133 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIM1P81133 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIM1P81133 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIM1P81133 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIM1P81133 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms