Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms