Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB11Q9Y547 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB11Q9Y547 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB11Q9Y547 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB11Q9Y547 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB11Q9Y547 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB11Q9Y547 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB11Q9Y547 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB11Q9Y547 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms