Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP1Q9NZI2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP1Q9NZI2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms