Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX22Q96L94 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms