Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CKAP5Q14008 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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