Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBP07199 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPBP07199 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPBP07199 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPBP07199 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPBP07199 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPBP07199 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPBP07199 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPBP07199 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBP07199 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms