Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms