Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms