Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT8L2Q96SF2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms