Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms