Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPC1P35052 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPC1P35052 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPC1P35052 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms