Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms