Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms