Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms