Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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