Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PLEKHA7-219ENST00000637162 3602 ntTSL 510.62□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PLEKHA7-210ENST00000530489 3688 ntTSL 1 (best)10.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)10.56□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CALD1-211ENST00000445569 525 ntTSL 510.49□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PCCA-211ENST00000636366 1654 ntTSL 510.42□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 AP2A2-203ENST00000524559 935 ntTSL 510.41□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ATP11A-214ENST00000493489 583 ntTSL 310.38□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ATAD1-201ENST00000308448 4640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PYGB-201ENST00000216962 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FOXO1-203ENST00000636651 1773 ntTSL 510.31□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZNF670-ZNF695-201ENST00000465049 1042 ntAPPRIS P5 TSL 510.24□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZBED3-AS1-205ENST00000507749 540 ntTSL 410.17□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZBED3-AS1-211ENST00000513591 1737 ntTSL 29.98□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PCCA-213ENST00000636475 1971 ntTSL 59.94□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP63-203ENST00000354446 1835 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FSD1L-207ENST00000484973 1711 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KIF2C-205ENST00000455186 908 ntTSL 59.91□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ADGRD1-205ENST00000535015 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.829e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CSTF1-201ENST00000217109 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 LONRF1-205ENST00000526680 2841 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.844e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PKP4-203ENST00000411900 552 ntTSL 49.75□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SSFA2-203ENST00000409136 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 WDR36-204ENST00000513710 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SPRED2-208ENST00000474228 876 ntTSL 39.56□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RERE-214ENST00000488215 962 ntTSL 39.55□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PKP4-208ENST00000462335 561 ntTSL 49.51□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP63-201ENST00000332047 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FSD1L-203ENST00000394926 1947 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 BX293535.1-201ENST00000443579 283 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TMEM39A-207ENST00000482162 554 ntTSL 59.4□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TMEM39A-210ENST00000490099 868 ntTSL 39.4□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SSBP3-215ENST00000533946 431 ntTSL 39.26□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 CALD1-202ENST00000361901 4114 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 ZBED3-AS1-215ENST00000514905 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TMEM39A-208ENST00000486159 826 ntTSL 39.1□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TAF8-205ENST00000465926 1222 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.027e-10■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 KIF2C-204ENST00000452259 1124 ntTSL 58.56□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CCR6-203ENST00000400926 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 EIF4A3-206ENST00000575978 3593 ntTSL 28.33□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GLRX-201ENST00000237858 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GLRX-202ENST00000379979 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 GLRX-204ENST00000507412 3407 ntTSL 27.62□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 EIF4A3-208ENST00000576573 697 ntTSL 27.55□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SSFA2-204ENST00000416081 5067 ntTSL 1 (best)7.37□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PLEKHA7-203ENST00000525049 563 ntTSL 47.37□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 DCP2-206ENST00000512751 570 ntTSL 37.21□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PLEKHA7-205ENST00000525581 539 ntTSL 47.2□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.267e-10■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZBED3-AS1-212ENST00000514114 527 ntTSL 37.1□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GLRX-205ENST00000507605 1734 ntTSL 27.08□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 LONRF1-202ENST00000524526 1246 ntTSL 27.02□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TTLL3-216ENST00000438596 540 ntTSL 56.93□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-221ENST00000561014 797 ntTSL 36.89□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP192-214ENST00000589596 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 26.88□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SSFA2-213ENST00000491720 6473 ntTSL 26.4□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KIF2C-208ENST00000493027 1091 ntTSL 56.17□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TMEM39A-209ENST00000486235 885 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.451e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ALB-204ENST00000441319 591 ntTSL 45.78□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TMEM39A-212ENST00000497993 590 ntTSL 35.48□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.561e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TCF19-204ENST00000542218 805 ntTSL 34.92□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 35.3
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