RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514640.5

ZBED3-AS1-214, ZBED3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZBED3-AS1, Length 1,300 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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ZBED3-AS1-214ENST00000514640 APLP2Q06481 763 aa14.92□□□□□ -0.02
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ZBED3-AS1-214ENST00000514640 WIZO95785 1651 aa13.84□□□□□ -0.19
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ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SMARCA2P51531 1590 aa13.68□□□□□ -0.22
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ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PITPNM1O00562 1244 aa13.65□□□□□ -0.22
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ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.23
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.59□□□□□ -0.23
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HMGXB3Q12766 1538 aa13.58□□□□□ -0.24
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.53□□□□□ -0.24
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.52□□□□□ -0.25
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NCAPD3P42695 1498 aa13.52□□□□□ -0.25
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.47□□□□□ -0.25
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HAX1O00165 279 aa13.4□□□□□ -0.26
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PRDM2Q13029 1718 aa13.39□□□□□ -0.27
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