Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACHD1Q5VU97 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACHD1Q5VU97 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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