Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF628Q5EBL2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF628Q5EBL2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms