Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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