Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKD1Q15139 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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