Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP7AQ04656 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms