Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms