Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCL3P20749 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCL3P20749 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCL3P20749 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCL3P20749 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms