Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN4Q9NQC3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms