Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4CQ96DT6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms