Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms