Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms