Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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NCOA4Q13772 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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NCOA4Q13772 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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NCOA4Q13772 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NCOA4Q13772 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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