Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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