Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms