Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB5CP51148 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB5CP51148 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB5CP51148 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB5CP51148 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB5CP51148 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB5CP51148 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RAB5CP51148 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RAB5CP51148 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5CP51148 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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