Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP7BP35670 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP7BP35670 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms