Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEDO75530 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEDO75530 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEDO75530 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms