Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQK5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQK5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQK5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQK5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQK5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQK5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQK5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQK5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQK5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQK5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQK5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQK5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQK5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQK5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQK5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQK5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQK5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
U3KQK5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQK5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQK5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQK5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQK5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQK5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQK5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQK5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQK5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQK5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQK5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQK5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQK5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
U3KQK5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
U3KQK5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
U3KQK5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
U3KQK5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
U3KQK5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
U3KQK5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQK5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQK5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQK5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQK5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQK5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQK5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQK5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQK5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQK5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQK5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQK5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQK5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQK5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQK5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQK5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQK5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQK5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQK5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQK5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQK5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQK5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQK5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQK5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQK5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQK5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQK5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U3KQK5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U3KQK5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U3KQK5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U3KQK5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U3KQK5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQK5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQK5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQK5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQK5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQK5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQK5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQK5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQK5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQK5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQK5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQK5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQK5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQK5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQK5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQK5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQK5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U3KQK5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U3KQK5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U3KQK5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQK5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQK5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQK5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQK5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQK5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQK5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQK5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQK5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQK5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQK5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
U3KQK5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
U3KQK5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
U3KQK5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms